En 1998, Le groupe ayant signé avec une Major, sort l'album Waste Of Mind, proposant quelques titres de leur 1er opus revu à l'occasion ainsi que de nouvelles compositions. Cet album rencontre alors un énorme succès qui va permettre au groupe de sortir de l'anonymat notamment avec les hits "get back", "check" ou encore "the real me". En 2001, Zebrahead signe un partenariat avec la célèbre revue de charme Playboy à l'occasion de la sortie de son album Playmate Of The Year propulsé par le clip très hot de leur single au nom éponyme à l'album.
Le groupe part en tournée aux quatres coins de la terre avant de revenir 2 ans plus tard avec surement l'album le plus culte de leur carrière, MFZB (traduit simplement par Mother Fuckin Zebrahead Bitch). Ce disque propose un nombre incroyable de titres digne de devenir des tubes, parmi eux, Rescue Me , Hello Tomorrow , Into You etc... En plus d'un DVD, Blood Sweet & Beers, sortie en 2004 propoant un concert enregistré à Tokyo, le Japon aura droit même à son propre album intitulé Waste Of MFZB, avec des titres comme Are You For Real , Blindside et une surprenant reprise des Spice Girls avec le titre Wannabe.
Durant l'été de cette même année, Justin Mauriello quitte le groupe afin de se consacrer à son nouveau groupe I Hate Kate. Après quelques auditions, c'est l'ex membre du groupe Jank 1000, Matty Lewis, qui prend la place délaissé au sein de Zebrahead. Le groupe peut enfin revenir sur le devant de la scène avec Broadcast To The World, un album sortit en 2006 et qui se situe parfaitement dans la lignée de MFZB. La voix est certes différente mais les riffs et le style Zebrahead est bel est bien présent.
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